O CBN 2016 contou com 208 aulas distribuídas em 16 cursos pré-congresso, 36 mesas-redondas e 18 conferências plenárias, além de uma sessão de discussão de casos clínicos. Reunindo centenas de palestrantes, sendo 299 brasileiros (representando 19 estados, de todas as regiões do país) e 12 estrangeiros (de sete países diferentes). O congresso se firmou também como importante cenário para divulgação de trabalhos científicos; no total foram apresentados 1001 pôsteres e 72 temas livres orais. O resultado foi um evento de alto nível médico-científico.